医疗洁净工程的主要目的，是为各类医疗活动提供洁净环境，进一步提高医疗质量。目前，医疗洁净水平已成为衡量医院综合实力的标准之一。我们平常所说的医疗洁净主要包含以下几个方面：
1. 手术室洁净
手术室洁净是医疗洁净的重要不成部分。通过手术室净化，使得手术室最大限度第保持接近无菌的清洁环境，减少术后感染。通常，一个完整的净化手术室分为洁净区、一般洁净区、非洁净区三个区域，以净化空调系统为主，装饰、电气系统、给排水系统的配合，达到手术需要的洁净度。
2. 医院其他洁净
以往医疗洁净主要应用于手术室，现在在其他科室也广泛应用，主要包括重症监护室ICU、NICU、PICU，血液层流病房、烧伤病房以及产房。这些净化大大改善了病人所处的环境，减少了术后感染，促进了病人的康复。
3. 医院中心供应室洁净
中心供应室是整个医院的无菌物品供应中心，主要为手术室提供无菌器械、无菌辅料及为其他科室提供无菌物品，是医院所有科室中最重要的部分之一，也是医疗洁净的重点。在医疗洁净中，一般把中心供应室分为污染回收区、清洁区、无菌区三个部分。
4. 实验室净化
在医院中，有各类的实验室，包括细胞实验室、HIV实验室、免疫实验室、PCR实验室、生殖中心实验室。实验室一般包括两种功能：化验与研究性实验。在医疗洁净中，实验室空气净化为实验设备稳定运行和医护人员的安全提供了有效的保障。
基本上上述四项内容，便是医疗洁净的主体内容了。有些净化公司把建设医用气体系统和医疗防护系统也纳入了医疗洁净。还有些情况下，医疗洁净的涵盖范围更为广泛，包括了医疗设备和药品生产车间的净化。
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